Gdy 30 października 1984 r. odnaleziono ciało ks. Jerzego Popiełuszki, należało podjąć decyzję, gdzie zostanie on pochowany. Początkowo postanowiono, że będzie to cmentarz na warszawskich Powązkach. Wielu przyjaciół zmarłego, wierni i – przebywający wówczas w szpitalu – proboszcz parafii ks. prałat Teofil Bogucki prosili władze kościelne, aby zezwoliły na pochowanie ks. Jerzego przy świątyni. Kard. Józef Glemp przychylił się do tych próśb.

Projekt grobu stworzył znany artysta plastyk Jerzy Kalina.
Grób ma kształt kurhanu. Otacza go różaniec z polnych kamieni ułożonych w kształcie granic Polski. Krzyż różańca jest położony w centrum mogiły – tam, gdzie znajduje się grobowiec. Łącznik ma kształt Orła w koronie z Matką Bożą Jasnogórską na piersiach.
Nad grobem – na drzewie – umieszczono wykonaną z brązu figurę Chrystusa wg projektu arch. Gustawa Zemły.

SŁUŻBY CZUWAJĄCE PRZY GROBIE BŁOGOSŁAWIONEGO

Od dnia pogrzebu bł. ks. Jerzego Popiełuszki, dzień i noc, przy jego grobie czuwają członkowie Kościelnej Służby Porządkowej „TOTUS TUUS”, którą kieruje p. Jan Marczak. Dbają o porządek w tym świętym miejscu. Wielu z nich złożyło przysięgę, że będą służyć przy grobie bł. Kapłana-Męczennika dopóki starczy im sił. Są z tego dumni. Przyjeżdżają z różnych warszawskich dzielnic i z całej Polski – z Bydgoszczy, Gdańska, krakowskich Mistrzejowic, Nowego Targu, Poznania, Radomia, Siedlec, z Zakopanego.

Opiekę nad pielgrzymami sprawuje Kościelna Służba Informacyjna, którą kieruje p. Katarzyna Soborak. Jej członkowie dzielą się świadectwem o świętości życia bł. ks. Jerzego Popiełuszki z pielgrzymami i turystami, którzy przybywają do jego grobu. W pierwszych dniach po pogrzebie bł. ks. Jerzego grupa ta spontanicznie zaczęła zbierać i porządkować materiały związane z osobą obecnego Błogosławionego oraz dokumentować upamiętniające go wydarzenia. Tak powstało Archiwum bł. ks. Jerzego Popiełuszki.

Przy grobie bł. ks. Jerzego zawsze stoją świeże, pięknie ułożone kwiaty i płoną znicze. Grobem opiekuje się Służba Pomocnicza, za którą odpowiedzialna jest p. Jadwiga Janucik. To dzięki codziennej pracy jej członkiń grób bł. ks. Jerzego jest starannie uprzątnięty.

Przez czas, jaki upłynął od śmierci bł. ks. Jerzego Popiełuszki członkowie Służby Liturgicznej, którą kieruje p. Leon Łochowski dbają o odpowiednią oprawę artystyczną Mszy św. za Ojczyznę oraz innych uroczystości, ubogacając je śpiewem i poezją.

Podczas wszystkich uroczystości, jakie mają miejsce w naszym kościele, lekarze i pielęgniarki zapewniają wiernym opiekę i pomoc w chwili fizycznej słabości. Grupą Medyczną kieruje dr Hanna Sulikowska.